酵母双杂系统-蛋白互作研究的好帮手
酵母双杂交系统在1989年由Fields和Song研究并开发,是目前探究蛋白质-蛋白质相互作用的所有实验系统中简单灵活且高效率的方法之一。可应用于互作蛋白的筛选、蛋白相互作用的鉴定/验证,药物作用位点筛选和药物对蛋白互作影响研究等方面。
酵母双杂交系统优势
简单高效:构建表达载体即可实现蛋白互作研究,省去蛋白表达、纯化等步骤;
高敏感性:可满足相对较弱的蛋白互作以及瞬时发生的蛋白互作检测;
真实性优:一定程度上保留蛋白质的折叠与空间构像,最大限度接近真实生理形态;
应用广泛:可对不同组织、器官、细胞、分化阶段材料进行文库构建和筛选;
酵母双杂交原理
图片来源:维基百科
完整的酵母转录因子GAL4从结构上以及功能上可以划分成相对独立的两个结构域: DNA结合结构域(BD)和DNA转录激活结构域(AD)。其中BD可以识别并结合GALA的上游激活序列UAS,而AD与BD相互靠近并结合会招募转录因子,从而促进下游转录机制的进行。在酵母双杂交系统中, 表达“诱饵”(bait)蛋白的cDNA构建到含BD的载体中,表达BD-bait融合蛋白,表达“猎物”(prey)蛋白的cDNA构建至含AD载体中,表达AD-prey融合蛋白。如果bait与prey蛋白之间有相互作用并能形成蛋白-蛋白复合物,可使AD和BD彼此靠近,从而激活下游转录机制的进行。通过检测报告基因表达与否,可以获取蛋白质间相互作用的有效信息。
常见的报告基因表达检测方式
图片来源:Paiano A et al. Curr Protoc Protein Sci. 2019
功能互补:报告基因HIS、ADE、LACZ、MEL1的激活,使得酵母可在营养缺陷型培养基(缺乏Leu/Trp/His/Ade)上生长。
显色反应:报告基因表达α-半乳糖苷酶,使X-α-Gal显色底物变蓝。有时还可选择金担子素A作为进一步检测的报告因子。
通常选择功能互补和显色反应相结合的方式确保筛选到阳性菌落。
酵母双杂系统的应用
1. 发现新的蛋白质和蛋白质的新功能
2. 在细胞体内研究抗原和抗体的相互作用
3. 筛选药物的作用位点
4. 建立基因组蛋白连锁图。
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