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人non coding RNA测序

作者：北京贝瑞和康生物技术有限公司 2012-07-10T00:00 (访问量:5113)

Non-coding RNA(ncRNA): 泛指不翻译蛋白质的RNA（non -messenger），一般熟知的包括rRNA, tRNA,及snRNA等熟知的ncRNA。但近来Non-coding RNA的研究日趋增多，逐渐变成研究热点的原因是发现其他的non-coding RNA具有调控基因功能的作用。这类regulatory RNA包括small non-coding RNA(microRNA、siRNA、piRNA等)及Long non-coding RNA (lncRNA)。
Long non-coding RNA (lncRNA)：是一类转录本长度超过200nt的RNA，它们本身并不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。生物体内含量相相当丰富，约占RNA的4-9%（mRNA约占1-2%，）。lncRNA的组织特异性及特定的细胞定位，显示lncRNA受到高度严谨的调控，目前已知其与发育、干细胞维持、癌症及一些疾病相关。随着近年来lncRNA不断被发现，人们开始关注lncRNA在各种生物学过程以及疾病中所起到的作用。
Large intergenic noncoding RNA(lincRNA)：是一类位于编码蛋白基因之间，长度超过200nt的长链非编码RNA（位于基因间的lncRNA）。lincRNAs起初被认为是基因组转录的“噪音”，是 RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lincRNAs参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lincRNAs的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。
microRNAs（miRNAs）：是小的非编码RNA，长度为20-23nt，由基因组转录。microRNA通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体（RISC）降解mRNA或抑制 mRNA的翻译，从而在转录后水平调控蛋白表达（最新发现microRNA也能在转录水平调控基因表达）。microRNAs在物种进化中相当保守，在动物，植物和真菌等中发现的microRNAs表达均有严格的组织特异性和时序性。microRNA在细胞生长和发育过程中起多种作用，包括调控发育，分化，凋亡和增殖等。
Piwi-interacting RNAs(piRNAs)：是一类从雄性生殖细胞中分离出的小的非编码RNA，它通常与Piwi蛋白相互作用，在精子发生过程中起着重要的生理调节作用。成熟piRNA分子是长度为26-32nt的单链RNA，序列上极为不保守。90%的piRNA分布于基因间序列。

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