产品简介:
对微量的双链DNA进行定量在各种生物学应用中都显得非常重要。例如cDNA文库的构建,亚克隆的DNA
片段的纯化,定量DNA扩增产物,在药物中DNA分子残留的测定等。检测核酸浓度最常用的方法就是检测
核酸再260nm (A260)处的光吸收,此方法主要的缺点是单链核酸和单核苷酸会产生干扰信号,核酸样品中的杂质也会影向结果。光吸收不能区分DNA和RNA,灵敏度也相对较低(用1cm的比色杯在A260值为0.1时相对应的双链DNA浓度为5μg/mL)。Peko Green(TM) 染料是一种新型的dDNA染料。其检测灵敏度高,可检测到pg级DNA。检测范围宽,可跨越4个数量级。特异性好,基本不受ssDNA和RNA的影响,并且可以耐受一定浓度的盐,尿素,已醇,氯仿,去垢剂,蛋白等干扰。目前使用Peko Green(TM) 染料定量检测DNA已经广泛用于生物学检测。
光学性质:
激发波长= 502 nm
发射波长= 523 nm
实验方法:
1. 试剂准备
Peko Green是以1毫升的浓缩液形式保存在无水DMSO(二甲基亚砜)中。实验当天,配制2x Peko
Green试剂的工作溶液,用1xTE液(10mM的Tris-HCl,1mM EDTA中,pH值为7.5)按1:200的比例稀释浓缩液。如果要准备好足够的工作液检测20个样品,可在20毫升1xTE加入100mL Peko Green dsDNA定量试剂。由于试剂容易吸附到玻璃表面,要在一个塑料容器中配制。Peko Green试剂容易光降解,所以应将配好的溶液用箔包主或放置暗处避光保存。
溶液最好在配制数小时内使用,以保证最佳结果。
2.DNA标准曲线
* 标准品工作液的配制:Sigma小牛胸腺DNA干粉(货号:D4522-1MG)1mg (Tris,
NaCL等浓度已成标准体系),加入1mL双蒸水,配制成1mg/mL的标准工作液。
* 标准品工作液的稀释:
* 母液稀释:取10mL(1mg/mL) 标准品工作液加入到990
mLTE溶液中,稀释成10mg/mL。再取10mL(10mg/mL)标准品工作液加入到990
mLTE溶液中,稀释成100ng/mL。
* 倍比稀释:取800mL(100ng/mL) 标准品工作液加入到200
mLTE溶液中,稀释成80ng/mL(药典规定:荧光染色方法DNA含量在。25-
80ng/mL范围线性较好,此方法DNA检出限为0.3ng/mL)。再取500mL(80ng/mL)标准品工作
液加入到500
mLTE溶液中,浓度稀释到40ng/mL。然后按倍比稀释成20ng/mL,10ng/mL,5ng/mL,2.5ng/m
L,1.25ng/mL,0.625ng/mL的标准品溶液,见表1。
1标准品工作液及样品排续在一个实心的黑色96孔板*
S0 DS0 …. ….
样品 样品
S1 DS1 …. …. …. ….
S2 DS2
S3 DS3
S4 DS4
S5 DS5
S6 DS6
S7 DS7注: DS= 标准品工作液从0到40ng/mL平行样品。
双链DNA样品分析:
* 倍比稀释后的各梯度标准品溶液,样品,和染料工作液各取100mL混匀,避光室温放置5分钟见表1。
备注: 如果用 384孔板, 则倍比稀释后的各梯度标准品溶液,样品,和染料工作液各取25mL即可。
* 用荧光酶标仪在激发/发射波长= 490/525 nm(截止波长为510 nm)检测荧光强度。
* 样品DNA 含量可根据标准品曲线算出。