外显子捕获测序服务

简介

外显子组是指全部外显子区域的集合，该区域包含合成蛋白质所需要的重要信息，涵盖了与个体表型相关的大部分功能性变异。外显子组序列捕获及第二代测序是一种新型的基因组分析技术：外显子序列捕获芯片（或溶液）可在同一张芯片上以高特异 性和高覆盖率捕获研究者感兴趣的目标外显子区域，后续利用Hiseq 2000或SOLiD 5500测序仪测序直接解析数据。
与全基因组重测序相比，外显子组测序只需针对外显子区域的DNA即可，覆盖度更深、数据准确性更高，更加简便、经济、高效。可用于寻找复杂疾病（如：癌症、 糖尿病、肥胖症等）的致病基因和易感基因等的研究。同时，基于大量的公共数据库提供的外显子数据，我们能够结合现有资源更好地解释我们的研究结果。

斯坦福大学医学院遗传学系的研究人员对市场上主流的外显子组测序平台进行了比较。该研究结果发表在《Nature Biotechnology》上，Nature Biotechnology 29, 908–914 (2011) doi:10.1038/nbt.1975。研究人员还比较了同一样品的外显子组测序和全基因组测序（WGS），显示外显子组测序能够检测到全基因组测序错过的小变异。

技术特点
1. 发现外显子区的绝大部分的疾病相关变异

2. 可发现常见变异和频率<5%低频突变

3. 只对基因组的约1%测序，更加经济、高效

4. 在相同预算情况下，可提供更高深度测序

样本要求

1)  样品纯度：OD 260/280值应在1.8～2.0 之间；无降解、无RNA污染。

2)  样品浓度：最低浓度不低于50ng/μl。
3)  样品总量：每个样品总量不少于15μg。
4)  样品溶剂：应溶解在纯水或TE （pH 8.0）中。
5)  样品运输：DNA低温运输（-20℃）；且在运输过程中请用parafilm将管口密封好，以防出现污染。

检测流程

SOLiD5500外显子组测序流程

全新的SOLID 5500XL系列测序平台拥有更高的准确度，更胜一筹的突变检测，超精确检测模块（ECC）可提供高达99.99%

的精确性，明显减少因碱基错配而出现的错误，并能消除相位不同步的问题。多达98%的可定位碱基质量值高于45

Illumina Hiseq 2000外显子组测序流程

Illumina测序平台拥有更高的测序通量，更低的测序成本，在相同的预算下能够提供更高的覆盖倍数。

应用领域
在正常人中的相关研究

在孟德尔疾病和罕见综合症中的运用

在复杂疾病中的应用

在基因诊断中的运用