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上海泉脉生物科技有限公司
代谢组学研究服务

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产品名称: 代谢组学研究服务

英文名称: Metabonomics

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上海泉脉生物科技有限公司
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实验平台

 

LC-MS

 

液相色谱-质谱联用(LC-MS)可解决如下几方面的问题:不挥发性化合物分析测定;极性化合物的分析测定;热不稳定化合物的分析测定;大分子量化合物(包括蛋白、多肽、多聚物等)的分析测定。

 

技术服务内容

 

通过LC-MS分析技术,分析处理组和正常组生物样本的代谢组物,通过采集图谱数据,

 

利用统计分析方法寻找组间中具有差异性的代谢产物,并对其定性。

 

实验阶段:

 

☆预实验阶段:对相关的实验条件进行摸索,确定最佳的实验参数;

 

☆正式实验阶段:对样品进行实验操作,得到质谱图;

 

数据分析阶段:

 

数据预处理

 

差异分析

 

主成分分析

 

偏最小二乘判别分析

 

ROC诊断分析

 

预测模型构建

 

其他组学整合分析

 

 

 

GC-MS

 

气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术,采用电子轰击(EI)方式对代谢物组进行分析。本实验平台适宜于分析小分子、易挥发、热稳定、能气化的化合物。

 

技术服务内容:

 

通过GC-MS分析技术,分析处理组和正常组生物样本的代谢组物,通过采集图谱数据,利用统计分析方法寻找组间中具有差异性的代谢产物,并对其定性。

 

实验阶段:

 

☆预实验:对相关的实验条件(制备方法、仪器参数等)进行摸索,优化实验方法;

 

☆正式实验:对样品进行实验操作,得到质谱图;

 

数据分析:

 

数据预处理

 

差异分析

 

主成分分析(PCA)

 

偏最小二乘判别分析(PLS-DA)

 

ROC诊断分析

 

预测模型构建

 

多组学整合分析等

 

 

 

NMR

 

核磁共振(NMR)实验平台具有无损伤性,无辐射性,无偏向性等优点,已经广泛运用于代谢组学研究,我们能提供以下服务:
技术服务内容:
通过NMR分析技术,分析处理组和正常组生物样本的代谢组物,通过采集图谱数据,利用统计分析方法寻找组间中具有差异性的代谢产物,并对其定性。
实验阶段:
☆预实验阶段:对相关的实验条件(制备方法、仪器参数等)进行摸索,优化实验方法;

 

☆正式实验阶段:对样品进行实验操作,得到核磁共振谱;

 

数据分析:

 

数据预处理

 

归一化处理

 

主成分分析

 

最小偏二乘判别分析

 

差异代谢物的挖掘

 

多组学整合分析等

 

 

 

 

 

样品要求

 

 

 

样品数量

 

微生物和植物每组最少6个样品,模式动物每组最少10个,临床样本每组最少30个

 

样品收集

 

血清和血浆样品500μl/例(最少不能低于200μl/例),避免反复冻融,血浆样本使用肝素钠进行外周血采集,血清样本不加肝素钠,直接装入EP管即可

 

尿液样品,≥1ml/例,尿液分装到离心管,每管1ml,添加一滴(约10μl)质量体积为1/100(w/v)的叠氮化钠,-80度冻存寄送

 

细胞需要淬灭(反复冻融法、细胞超声破碎等)

 

组织、器官需要匀浆