MBS(mapping-by-sequencing)
产品名称: MBS(mapping-by-sequencing)
英文名称: MBS(mapping-by-sequencing)
产品编号:
产品价格: 0
产品产地: null
品牌商标: null
更新时间: null
使用范围: null
上海欧易生物医学科技有限公司
- 联系人 :
- 地址 : 上海市闵行区浦江镇新骏环路138号2幢4楼
- 邮编 : 201114
- 所在区域 : 上海
- 电话 : 400***0826 点击查看
- 传真 : 点击查看
- 邮箱 : market@oebiotech.com
MBS (mapping-by-sequencing)
针对有参考基因组的物种,利用混合分组分析(BSA , bulk segr egant analysis)结合全基因组重测序,将鉴别到的分子标记与性状进行共分离分析,对锁定到的目标区间内的基因进行功能注释,实现性状决定基因的快速定位。
欧易特色
● 与传统的图位克隆相比,耗时短、成本低、定位更准确
● 根据每个客户的研究目标和内容灵活定制研究方案
● 提供标准和高级生物信息分析,可根据客户需求提供个性化数据分析
● 欧易生物已成功完成拟南芥、水稻等多个物种突变体定位项目
项目流程
提取基因组DNA---测序文库构建(~350bp)---上机测序---原始测序数据---数据质控--标记分型---数据分析
推荐测序模式
● Hiseq4000, PE150 ● ≥30 X基因组大小
样品要求
● DNA:≥1 μg ● OD260/280为1.8-2.0
● 适用范围:
· 单倍体、二倍体或多倍体物种(有参考基因组) ·家系群体(F2、DH、RIL等皆可)
· 子代混池规模:质量性状≥50个个体;数量性状≥30个体且不超过总群体10%比例
数据分析内容
标准数据分析
● 数据质控
● 产出统计
● 比对参考基因组
● SNP位点的鉴定与分型
高级数据分析
● 统计全基因组SNP等位位点频率
● 绘制SNP等位位点频率累积曲线
● Causal mutation位点的鉴别
● Causal mutation位点的注释