宏基因组测序
产品名称: 宏基因组测序
英文名称: Metagenomic sequencing
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产品价格: 1000
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北京诺赛基因组研究中心有限公司
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技术简介:
宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养,而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序,能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系,极大地扩展了微生物学研究范围。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rDNA高变区/ITS 的PCR扩增产物进行高通量测序,分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律。
生物信息分析:
1.序列质量控制。
2. 组装序列:
a) 对组装后的contig进行基因预测。
b) 对contig进行序列映射,以得到基因的丰度。
c) 对基因进行注释。
d) 进行组间比较,找到差异基因或基因关联群所对应的基因家族、代谢途径、物种分类等等。
3. 不组装,直接对序列进行注释,进行组间比较。
技术优势:
1、适用范围广:很多自然界中的微生物并不能在实验室条件下进行培养,因此,无需进行分离培养而扩展了微生物研究范围。
2、真实性高:该方法对环境中微生物群落的多样性、功能基因等宏观特征进行了研究,更能有效、准确的反应出微生物的真实状态。
送样要求:
样品 | 要求 |
DNA | ≥5ug |
浓度 | ≥50ng/ul |
纯度 | OD 260/280 =1.8~2.0 ;无蛋白及RNA 污染 |