Illumina公司的Hiseq2000，Roche公司的454和ABI公司的5500xl，Ion torrent等最新的测序平台为广大用户提供了强大的下一代测序方法，为目前生物学，医学以及功能基因组学等热门研究领域提出了全新的应用方案。我公司在此领域拥有丰富经验的测序及生物信息学专家，具备丰富的实验设计、测序和生物信息分析经验，能够提供从方案设计到生物信息分析的整体解决方案，专门为广大科研领域的客户提供技术服务。目前公司服务的主要科研领域包括：微生物领域，疾病相关研究，农、林、畜牧及动植物领域的研究。

微生物基因组测序服务介绍

新的测序技术的发展导致了测序成本的大幅降低。我们基于新一代测序技术，推出以下微生物基因组测序服务：

细菌框架图，1个月完成；

细菌精细图，2个月完成；

真菌框架图，2个月完成；

真菌精细图，3个月完成；

目前细菌基因组研究进展迅猛，已有684个细菌基因组和51个古细菌基因组序列发布。新技术的应用让更多的实验室可以承担细菌基因组测序的费用，很多细菌基因组的测序工作已经在进行中。微生物基因组研究将会以更快的速度发展，并充满竞争。

一 、技术路线

基于新一代测序技术，基因组测序成本已经大大降低，而Paired-End技术的出现则大大降低了基因组组装的难度。因此基于新一代测序的技术路线，使细菌真菌基因组测序费用降低了很多，达到了传统测序技术的1/5到1/10，时间也大大缩短。

二、生物信息分析

生物信息分析是细菌基因组序列组装完成后的重要工作，我们公司除了提供世界上最先进的测序服务外，还提供常规生物信息分析内容以及到文章最后成型的一揽子解决方案，如：

基因组组装：包括原始数据统计；覆盖度计算；组装结果统计Scaffold N50，Contig N50；

基因组注释：coding gene注释；tRNA基因注释；rRNA注释；microRNA注释；重复序列注释；

基因功能注释：GO功能分类；Interpro功能分类；KEGG分类；

比较基因组分析（有近缘物种）：SNP检测；结构变异检测。

个性化分析：视具体课题内容而定。

三、 常见问题及解答

1、有什么样品要求？

1. 客户需要提供可以证明所提供DNA完整性和准确浓度的包括DNA检测的胶图, 紫外分光光度计（nanodrop）检测结果,或者Aglient 2100 Bio-Analyzer的检测结果中一种或多种形式的样品分析 结果；样品纯度：OD值应在1.8～2.0 之间；样品浓度：样品的浓度越高越好，最低不应低于30ng/μl；样品的量：每次样品制备需要10 μg样品，如果需要多次制备样品，则需要样品总量＝制备样品次数＊10μg；

2. 我们收到样品后，需要对样品进行检测，最终样品的量和纯度，以我们的检测结果为准，无论样本合格与否，我们都将提供完整的检测报告；

3. DNA如果用乙醇沉淀，则可以常温运输，否则在运输过程中，最好放在干冰中，时间不要超过72小时，如果利用冰袋运输，则时间最好不要超过24小时；且在运输过程中请用parafilm将管口密封好，以防出现污染；

4. 请客户仔细纯化样品，尽量避免污染进入，并请客户将所送样品保留备份，我们也将另外由专人保留一份备份，以防止一旦数据中出现外源DNA污染，我们能迅速的查清原因，分清责任；

5. 项目完成，数据提交给客户后，我们将不再保存样品，如果客户还需要样品，请在项目进行前予以说明，并在项目结束后一个月内将样品拿走，逾期我们将予以清理；

6. 所有的生物实验都不排除有意外情况发生，如果在样品制备过程中出现非正常情况，需要跟客户沟通，请客户谅解，提供新的样品DNA。

2、对于GC含量大于60%或小于35%时，如何收费？

GC含量大于60%或小于35%时测序和组装难度增加，需要增加测序量，具体标准和费用需要再协商。

3、哪些因素会影响测序结果的质量？

DNA样品的纯度如果不够，将会严重影响测序结果的质量。另外，对于高GC含量的物种，测序结果的质量会受到一定影响。

4、测序得到的数据保存期限是多久？

    在测序及分析过程中，将产生几个Gb的数据。项目结束后，这些文件需要客户自行准备足够空间的存储设备加以存储，原则上我们不给予额外保存。具体操作以合同为准。