流式细胞分选技术是利用流式细胞分选仪，以高能量激光照射高速流动状态下被荧光色素染色的单细胞或微粒，测量其产生的散射光和发射荧光的强度，从而对细胞（或微粒）的物理、生理、生化、免疫、遗传、分子生物学性状及功能状态等进行定性或定量检测的一种现代细胞分析技术，它可根据发射光的荧光强度和波长将发光颗粒亚群分开并可实现单克隆分选，能复杂样本中的细胞进行鉴定、分类、定量和分离，单次可同时对其中一种到四种特定细胞进行超高速分选纯化、高通量单克隆分选或细胞芯片制备。分选后的细胞能直接用于培养、移植、核酸提取、单细胞PCR扩增或原位杂交等，可进一步进行细胞基因、蛋白、功能水平的研究和不同细胞之间的差异化研究。硬件中样本细胞丢弃的比例低于5%，保证样本中目标细胞的高回收率。

特点：

1. 少量细胞分选时，流式细胞分选精确度高（99%以上），速度快。先进的流式细胞仪的分选速度可达25000个细胞/秒以上，比传统的分选速度提高了很多倍，需要一天的工作只需要几小时就能完成。不过流式细胞仪分离细胞的量还是有一定的限制，一次分离的最大合理量约为10个细胞。如果细胞量超过10个，则需要耗费10小时以上，分选后细胞的活力会受到很大的影响.

2. 可以同时进行多个Marker分选，正选负选同时进行。以前的流式细胞仪只能给液滴充上正电荷或负电荷，因此在电场中只能向左或向右偏转，即两路分选。仪器可以给液滴充以不同的电量，从而调整液滴的偏转角度，实现多路分选。BD的FACSAria流式细胞仪就可以进行四路分选。

3. 不仅仅限于表面抗原，流式细胞仪可以根据任何能检测到的发光度（如细胞体积）或荧光（如DNA、RNA或蛋白含量，酶活性，特异抗原）散射度差异来分离细胞。如果能保证流式细胞仪的无菌状态，那么分选后的细胞还可以进行培养或其他分析。

4. 如果只是偶尔做几次细胞分选的话，用流式分选还是比较划算的，只需要准备样品和抗体，交纳一定的仪器使用费即可，不需要购买配套的设备。

应用：

流式细胞分析/分选系统主要应用于：

1）干细胞组织工程在研究；

2）细胞增值、活性和凋亡研究；

3）疾病细胞如炎症细胞、肿瘤细胞等的发生、发展和转归研究；

4）基因表达和表达调控研究；

5）细胞内信号传导和生物大分子间相互作用研究；

6）各种病原体如病毒、细菌等基础和致病性和致病机理研究；

7）药理药效和药物开发研究；

8）移植和细胞治疗研究；

9）生物材料对细胞结构、活性和功能的影响等。

利用仪器的分选功能分选得到高纯度、高活性的稀有细胞，通过直接培养、诱导、增殖、分化、活化和移植等进行更深一步的细胞功能和细胞治疗探索，还可以在此基础上逆向进行基因组合蛋白质组相关研究，寻找致病基因、致病蛋白和疾病信号传导方式。