转录组测序服务
产品名称: 转录组测序服务
英文名称: Transcription Sequencing
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产品价格: 13761661902
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更新时间: null
使用范围: null
- 联系人 :
- 地址 : 上海市广元西路55号上海交大基因组学楼
- 邮编 : 200030
- 所在区域 : 上海
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转录组测序服务
简介
转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。
高通量转录组测序技术,无需了解物种基因信息,能够对任意物种进行转录组分析,并接测定每个转录本的片段序列,精确到单核苷酸的分辨率;动态达6个数量级,能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本,以及检测基因家族中相似基因和可变剪接造成的不同转录本的表达;被广泛的应用于转录本结构研究(基因边界鉴定、可变剪切研究等),转录本变异研究(如基因融合、编码区SNP研究),非编码区域功能研究(Non-coding RNA研究、microRNA前体研究等),基因表达水平研究以及全新转录本发现。
技术特点
1 单次转录组测序实验即可提供全面的转录组信息
2 转录组测序无需预先知道任何序列信息
3 转录组测序提高了动态检测范围和灵敏度
4 转录组测序可提供转录本中序列变异信息
样本要求
Illumina Hiseq 转录组测序服务
1) 样品纯度:OD 260/280值应在1.8~2.0 之间;260/230 在1.6-2.6 之间;电泳检测样品无降解,无基因组DNA污染,RIN ≥8.0
2) 样品浓度:total RNA浓度不低于50ng/ul。
3) 样品总量:每个样品总量不少于5μg。
4) 样品溶剂:应溶解在无核酸酶水中。
5) 样品运输:低温运输(-20℃);且在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染。
SOLiD4/SOLiD5500/Ion Torrent全转录组测序
1) 样品纯度:OD 260/280值应在1.8~2.2 之间;260/230 在1.8-2.3 之间;电泳检测样品无降解,无基因组DNA污染,RIN ≥8.0
2) 样品浓度:total RNA浓度不低于20ng/ul。
3) 样品总量:每个样品总量不少于2μg。
4) 样品溶剂:应溶解在无核酸酶水中。
5) 样品运输:低温运输(-20℃);且在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染。
检测流程
转录本结构研究(基因边界鉴定、可变剪切研究等),转录本变异研究(如基因融合、编码区SNP研究),非编码区域功能研究(Non-coding RNA研究、microRNA前体研究等),基因表达水平研究以及全新转录本发现。